โรงเรียนบ้านสระกระโจมได้จัดตั้งขึ้นเพื่อทำการสอนนักเรียนเมื่อวันที่ 10 พฤษภาคม 2483 โดยอาศัยศาลาพักร้อน  ซึ่งพระครูธรรมสารรักษา (หลวงพ่อพริ้ง) วัดวรจันทร์ อำเภอเมือง จังหวัดสุพรรณบุรีสร้างไว้ริมทางเกวียน เพื่อให้ผู้คนที่สัญจรไปมาได้พักอาศัย ใช้เป็นสถานที่เรียน โดยมีนายชั้น เรืองศรี เป็นครูใหญ่ จำนวนครูนักเรียนมีเท่าใด ไม่ทราบได้เพราะหลักฐานต่าง ๆ ได้สูญหายหมด

พ.ศ. 2486  นายณรงค์ ธีรกุล ดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ถึง พ.ศ. 2488

พ.ศ. 2489 นายเตี้ยม คล้ายทอง ดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ถึง พ.ศ. 2501

พ.ศ. 2497 ทางราชการได้เริ่มบูรณะอนุสรณ์ดอนเจดีย์ และได้แบ่งแยกการปกครองจากตำบลเป็นกิ่งอำเภอดอนเจดีย์ การคมนาคมสะดวกขึ้นจึงเป็นสาเหตุให้คนเริ่มอพยพมาอยู่ในท้องถิ่นมีมากยิ่งขึ้นพร้อมทั้งนักเรียนก็เพิ่มขึ้นเรื่อยๆ

พ.ศ. 2501 นายเมี้ยน พุกเศรษฐี ดำรงตำแหน่งครูใหญ่

พ.ศ. 2502 ประชาชนได้ร่วมกันบูรณปฏิสังขรณ์ วัดสระกระโจมได้สร้างศาลาการเปรียญขึ้น 1 หลัง จึงได้แบ่งนักเรียนส่วนหนึ่งมาเรียนที่ศาลาการเปรียญวัดสระกระโจม

พ.ศ. 2503 นายคล้อย พูลกำลัง ได้มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่มีนักเรียน 305 คน ครู 3 คน

พ.ศ. 2508 นายสงวน บุญรอด ได้รับคำสั่งให้มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ซึ่งขณะนั้นมีนักเรียน 400 คนเศษ ครู 8 คน ใช้ศาลาการเปรียญ 1 หลัง โรงลิเก 1 หลัง และอาคารเรียนชั่วคราว 1 หลัง เป็นสถานที่เรียน ส่วนโต๊ะเรียน ม้านั่ง ไม่มี ต้องนั่งเรียนกับพื้นกระดาน

พ.ศ. 2509 ทางราชการได้อนุมัติเงินงบประมาณของสำนักงานกินแบ่งรัฐบาลจำนวน 350,000 บาท สร้างอาคารเรียนแบบ 008 จำนวน 10 ห้องเรียน 1 หลัง วัสดุ ครุภัณฑ์ เช่น โต๊ะเรียนห้องเรียนละ 20 ตัว กระดานดำชนิดติดฝาผนัง ห้องละ 1 แผ่น โต๊ะทำงานครูห้องละ 1 ชุด คณะครูผู้ปกครอง นักเรียนและประชาชนได้ร่วมกันจัดวางศิลาฤกษ์ เมื่อวันที่ 23 เมษายน พ.ศ. 2509 โดยนายเอื้อ อยู่สุข นายอำเภอดอนเจดีย์เป็นประธาน โดยสร้างเป็นพื้นที่เอกเทศ ห่างจากวัดสระกระโจมมาทิศตะวันออก ประมาณ 700 เมตร ในพื้นที่ 16 ไร่ สร้างเสร็จสมบูรณ์เมื่อวันที่ 28 สิงหาคม พ.ศ. 2509

1 กันยายน 2509 ได้นำนักเรียน ทรัพย์สินต่างๆของโรงเรียนมาอยู่ในที่แห่งใหม่

พ.ศ. 2512 โรงเรียนได้เปิดเรียนชั้นประถมปลาย โดยทางราชการอนุมัติเงินงบประมาณให้อีก 100,000 บาท เพื่อสร้างอาคารเรียนแบบ 014 ที่ว่างนั้น ได้ย้ายนักเรียนที่เรียนอยู่อาคารชั่วคราวไปแทน

12 กรกฎาคม 2515 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารอเนกประสงค์ (อาคารโรงฝึกงาน) เป็นของปีงบประมาณ 2515 แบบกรมสามัญได้มาจากงบประมาณขององค์การบริหารส่วนจังหวัด ขนาดกว้าง 7.00 เมตร ยาว 17.15 เมตร เสาไม้เนื้อแข็งพื้นคอนกรีตเสริมเหล็ก โครงหลังคาไม้ มุงกระเบื้องลอนคู่เป็นจำนวนเงิน 45,000 บาท

10 กันยายน 2518 ได้งบประมาณสร้างอาคารประกอบแบบ กสช. ปีงบประมาณ 2518 ขนาดกว้าง 7.00 เมตร ยาว 28.00 เมตร เสาไม้เนื้อแข็ง พื้นคอนกรีตเสริมโครงเหล็ก หลังคาไม้ มุงกระเบื้องลอนคู่เป็นจำนวนเงิน 150,000 บาท

พ.ศ. 2523 ได้งบประมาณจากทางราชการมาต่อเติมอาคารเรียนแบบ 017 อีก 4 ห้องเรียนเป็นจำนวนเงิน 200,000 บาท

พ.ศ. 2526 ทางโรงเรียนได้ขยายเขตการใช้กระแสไฟฟ้ามาใช้ในโรงเรียนโดยผู้ปกครองนักเรียนและประชาชนได้บริจาคทรัพย์ เพื่อสมทบด้วยเป็นจำนวนเงินคนละ 900 บาทและท่านพระครูโสภณอรรถโกวิท เจ้าอาวาส  วัดสระกระโจมได้มอบอุปกรณ์ไฟฟ้าให้ทางโรงเรียนคิดเป็นเงิน 14,000 บาท

พ.ศ. 2528 สำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติได้อนุมัติเงินงบประมาณทางราชการมาติดตั้งไฟฟ้าให้กับโรงเรียนและกรมทรัพยากรธรณีได้มาขุดเจาะบ่อบาดาลให้กับทางโรงเรียน ขนาด 6 นิ้ว ลึก 370 เมตร ทางโรงเรียนยังไม่สามารถนำน้ำขึ้นมาใช้ได้  

1 ตุลาคม 2529 นายประคอง คำพุช ได้มาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่แทนนายสงวน บุญรอด ซึ่งเกษียณอายุราชการ

12 กุมภาพันธ์ 2530 โรงเรียนได้รับอนุเคราะห์จากศูนย์ปฏิบัติการเร่งรัดพัฒนาชนบท จังหวัดสุพรรณบุรี ได้มาเจาะบ่อบาดาลให้กับโรงเรียนพร้อมทั้งติดตั้งหัวโยกสูบน้ำขึ้นมาใช้ได้

27 กรกฎาคม 2530 ได้รับงบประมาณสร้างสนามวอลเลย์บอลแบบคอนกรีตเสริมเหล็ก ขนาดกว้าง 13 เมตร ยาว 22 เมตร เป็นเงิน 60,000 บาท

29 สิงหาคม 2530 ได้รับงบประมาณสร้างเรือนเพาะชำ แบบ พ.1 ขนาด 4.00 เมตร ยาว 6.00 เมตร เป็นจำนวนเงิน 15,000 บาท

พ.ศ. 2537 เป็นโรงเรียนผู้นำพัฒนาการนิเทศภายในโรงเรียนระดับแนวหน้าของสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดสุพรรณบุรี

พ.ศ. 2538 ได้จัดสร้างห้องประกอบอาหารกลางวัน โดยขอความร่วมมือจากผู้ปกครองนักเรียนในการจัดสร้าง ใช้งบประมาณเป็นเงินจำนวน 80,000 บาท โดยไม่ใช้งบประมาณของทางราชการ

พ.ศ. 2539 เป็นโรงเรียนในโครงการศึกษาเพื่อพัฒนาชนบท

พ.ศ. 2540 ได้รับการคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนปฏิรูปการศึกษาและได้รับการคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนศูนย์ปฏิรูปการศึกษา

10 เมษายน 2541 นายธีรพล ว่องกิตติพงษ์ ย้ายมาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ แทนนายประคอง คำพุช ที่ย้ายไปโรงเรียนบ้านหนองสลัดได

พ.ศ. 2541 ได้รับการคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนนำร่องโรงเรียนสีขาวของสำนักงานการประถมศึกษาอำเภอดอนเจดีย์

พ.ศ. 2541 ได้รับการคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนการใช้ข้าวกล้อง เพื่อโครงการอาหารกลางวันของสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดสุพรรณบุรี

พ.ศ. 2541 ได้จัดสร้างสร้างสวนหย่อมหน้าอาคาร 008 ได้รับงบประมาณจากประชาชนเป็นจำนวนเงิน 19,000 บาท สร้างอุปกรณ์สนามเด็กเล่นจำนวน 6 ชิ้น เป็นเงินจากประชาชนบริจาค 38,000 บาท

พ.ศ. 2542 ได้จัดสร้างและดำเนินการสร้างโรงจอดรถจักรยานนักเรียน โดยประชาชนดำเนินการและสนับสนุนงบประมาณ 8,000 บาท สร้างทางเชื่อมต่ออาคาร 008 - 017 โดยใช้งบประมาณของทางราชการ 20,000 บาท และประชาชนสมทบ 11,000 บาท  ได้รับคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนนำร่องโครงการบริการสุขภาพอนามัยนักเรียน เทศบาลตำบลสระกระโจมสนับสนุนงบประมาณจัดสร้างถนนคอนกรีตเสริมเหล็ก ขนาด 4 เมตร ยาว 200 เมตร ให้กับโรงเรียน

21 มิถุนายน 2542 ได้รับอนุมัติให้รื้อถอนบ้านพักครูทะเบียนราชพัสดุลำดับที่ 2, 3 สร้าง เมื่อปี พ.ศ. 2513 และ 2514 ตามลำดับ

13 มกราคม 2553 ได้รับอนุมัติให้รื้อถอนเรือนเพาะชำ และอาคารอเนกประสงค์ แบบ กสช.

พ.ศ. 2553 จัดสร้างอาคารกองอำนวยการ เพื่อจัดกิจกรรมกลางแจ้งโดยประชาชนบริจาค เป็นเงิน 29,000 บาท

9 มีนาคม 2543 ได้รับอนุมัติให้ก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 105/29 จำนวน 4 ห้องเรียน 1 หลังงบประมาณ 1,440,000 บาท

พฤษภาคม 2543 ได้รับงบประมาณก่อสร้างถังเก็บน้ำฝน แบบ ฝ.33 จำนวน 1 ชุด งบประมาณ 60,000 บาท และสร้างสนามฟุตบอล จำนวน 1 สนาม แบบ พ.1 งบประมาณจำนวน 100,000 บาท

มิถุนายน 2543 ได้รับงบประมาณจากกรมประมงปรับปรุงสระน้ำจำนวน 30,000 บาทและพันธุ์ปลาพร้อมอาหารปลา 3 ปีการศึกษา

เป็นโรงเรียนต้นแบบในโครงการวิจัยระบบดี โรงเรียนมีคุณภาพของสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรีเขต 2

พ.ศ. 2549 เป็นโรงเรียนต้นแบบฝึกงานของผู้สอบในตำแหน่งผู้อำนวยการ รองผู้อำนวยการโรงเรียนที่สอบผ่านเกณฑ์ของสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 2

ได้รับงบประมาณปรับปรุงสระน้ำ โดยประมาณของเทศบาลตำบลสระกระโจม

พ.ศ. 2550 นายกฤษณะ พลายละหาร ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านสระกระโจม

7 พฤษภาคม 2550 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ สปช. 105/29 จำนวน 5 ห้องเรียน

พ.ศ. 2554 ได้คัดเลือกเป็นโรงเรียนดีศรีตำบล

พ.ศ. 2558 เป็นโรงเรียนเกษตร อาหารกลางวัน โภชนาการตามแนวพระราชดำริสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาสยามบรมราชกุมารี

30 กันยายน 2564 นายกฤษณะ พลายละหาร เกษียณอายุราชการ

11 ตุลาคม 2564 นางสาวคณิดา พักตร์เพียงจันทร์ ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านสระกระโจม

ธันวาคม 2564 นายบุญเลิศ ค่อนสะอาด ปฏิบัติหน้าที่ในตำแหน่งที่ปรึกษาด้านมาตรฐานการศึกษาสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐานเข้าตรวจเยี่ยมและให้คำแนะนำปรึกษาด้านมาตรฐานการศึกษาในโรงเรียนเครือข่ายโรงเรียนคุณภาพ

9 พฤษภาคม 2565 นายธีร์ ภวังคนันท์ ผู้ตรวจราชการกระทรวงศึกษาธิการ พร้อมคณะ เข้าตรวจราชการและติดตามความก้าวหน้าการขับเคลื่อนนโยบายเร่งด่วนของกระทรวงศึกษาธิการ ระยะแรก (ก่อนเปิดเทอม) ครั้งที่ 2 เขตตรวจราชการที่ 3

มีการขับเคลื่อนนโยบายเร่งด่วนของกระทรวงศึกษาธิการด้านความปลอดภัยของโรงเรียน ผ่านโครงการปรับปรุงภูมิทัศน์อนุรักษ์สิ่งแวดล้อมภายในสถานศึกษา โครงการพัฒนาปรับปรุงห้องเรียนให้มีความปลอดภัย โดยการปรับปรุงซ่อมแซมเวที ประตู โต๊ะ เก้าอี้ และทามีภายในห้องเรียน ปรับปรุงซ่อมแซมห้องน้ำ ขุดลอกสระน้ำเพื่อปรับสภาพแวดล้อม ปรับปรุงซ่อมแซมสนามเด็กเล่น

สีประจำโรงเรียน : สีเหลืองและสีม่วง